La paratuberculosis o la enfermedad de Johne -EJ- es una enfermedad infecciosa causada por Mycobacterium avium el cual afecta rumiantes domésticos y salvajes, además de otras especies. La presente revisión pretende exponer las alternativas diagnósticas disponibles actualmente para la detección del agente y de la enfermedad definiendo sus características, aplicaciones y desventajas.